政府会计年终清理的内容主要包括以下几个方面，综合多个权威来源整理如下：

一、核对年度预算

1. 预算调整与转移支付

年终前需完成本级政府财政预算与上级、下级政府财政总预算及各部门预算的核对，处理追加追减、上划下划等调整事项，确保预算数一致。

2. 预算拨款截止时间

各项预算拨款需在12月25日前办理完毕，确保与支出列报时间一致。

二、清理本年预算收支

1. 收入清理

督促征收部门及时缴库本年预算收入，核对财政专户管理资金和专用基金收支，催收应列入本年的收入并缴入国库。

2. 支出清理

核对并清理本年预算支出，收回应收款项冲减支出，预拨下年度经费不得列入当年支出。

三、组织年度对账

1. 与国库对账

年终后组织征收机关与国库进行年度对账，核对库款报解整理期内的收入数据，确保财政收入数字一致。

2. 内部核对

各级总预算会计需与下级单位核对拨款支出，编制对账单并签章确认。

四、清理往来款项

1. 往来账务清理

年终前清理单位间的往来款项，将应转作收入或支出的款项转入相关账户，结清账务。

2. 财政专户管理

核对财政专户收支，确保专款专用，及时拨转应返还所属单位的部分。

五、核实股权、债权和债务

1. 资产与负债核对

财政部门需与相关资产、债务管理部门提供资料，核对股权、债权、债务等核算信息，确保账实相符。

六、年终财政结算

1. 收支汇总与报表编制

结合核对后的预算收支数据，编制年终财政决算报表，反映全年预算执行结果。

2. 财务分析

通过决算数据分析预算执行情况，检查财经纪律规范性，为下一年度预算编制提供参考。

七、软件操作注意事项（以用友政务为例）

1. 科目结转模板

使用“年末收入结转”模板自动生成预算收入结转凭证，确保财务会计与预算会计科目期末无余额。

2. 数据审核

结转前需检查凭证审核状态，避免遗漏未记账或重复记账的情况。

以上内容综合了《财政总预算会计制度》及政府会计制度要求，确保年终清理工作的规范性与完整性。