当二建证书被中介注册后，如果中介不配合注销，持证人需要采取一系列措施来维护自己的权益。以下是一些常规和非常规的解决方法，以及相关法律建议。

常规解决方法

与企业协商

首先，持证人应尝试与聘用企业协商，说明情况并要求办理注销手续。如果企业不同意，可以提供与原企业解除劳动关系的有效证明材料，如劳动合同解除证明或劳动仲裁裁决书。
与企业协商是最直接的方法，但在实际操作中，企业可能因为资质延续等原因不愿意配合。因此，持证人需要准备好相关证明材料，以备不时之需。

向主管部门申请强制注销

如果企业不配合，持证人可以向省级建设主管部门申请强制注销。需要提供与原企业解除劳动关系的有效证明材料，如解聘证明、劳动仲裁裁决书或法院判决书。
向主管部门申请强制注销是法律赋予持证人的权利，但在申请过程中可能会遇到企业不配合的情况。因此，持证人需要准备好所有必要的材料，并了解具体的申请流程和要求。

向相关部门投诉

持证人可以向当地市长热线、建设部门或12345市民热线投诉，反映企业或中介不配合注销的情况。这些部门可能会介入协调，帮助企业或中介配合办理注销手续。
投诉是一种有效的方式，可以借助政府部门的压力解决问题。但需要注意的是，投诉可能会影响企业的资质，因此在投诉前应充分评估利弊。

非常规解决方法

通过社保局停掉企业的社保

持证人可以向当地社保局投诉，称企业在其不知情的情况下购买了社保，要求停掉该企业的社保。社保局会核实情况，并可能要求企业配合办理注销手续。这种方法通过影响企业的运营来迫使企业配合注销，可能会对企业造成一定的压力。但需要注意的是，这种方法可能会引起企业的反感和抵触，需谨慎使用。

拨打12345市长热线

持证人可以拨打当地12345市长热线，说明情况并要求协调办理注销手续。工作人员会留下持证人电话，并联系企业处理。12345热线是一个有效的投诉渠道，可以快速引起相关部门的重视。但需要注意的是，这种方法可能需要多次拨打，且效果不一定立竿见影。

法律途径

提起诉讼

如果以上方法都无法解决问题，持证人可以向法院提起诉讼，要求企业配合办理注销手续。在诉讼过程中，需要提供相关证明材料，如合同、协议、通讯记录等。
诉讼是最后的手段，但在法律程序中，企业需要配合提供相关证据。因此，持证人需要准备好所有必要的材料，并了解相关的法律程序和费用。

当二建证书被中介注册后，如果中介不配合注销，持证人可以通过与企业协商、向主管部门申请强制注销、向相关部门投诉、通过社保局停掉企业的社保、拨打12345市长热线以及提起诉讼等多种方式来维护自己的权益。每种方法都有其优缺点，持证人应根据具体情况选择最合适的方式，并在必要时寻求法律帮助。