公司开具增值税专用发票（专票）与普通发票（普票）的成本存在显著差异，主要体现在进项税额抵扣和成本核算方面。以下是具体分析：

一、核心区别总结

专票可抵扣增值税，普票仅作成本核算，导致实际成本更低。

（适用于一般纳税人企业）

二、详细对比

1. 进项税额抵扣

   • 专票 ：进项税额可全额抵扣销项税额，例如购入原材料取得13%税率专票，可减少20%增值税负担。

   • 普票 ：无法抵扣增值税，需全额计入成本。

2. 成本核算差异

   • 专票 ：成本为不含税金额，实际税负更低。例如，含税价100万元，专票可抵扣13%税额，成本为87.3万元。

   • 普票 ：成本为含税金额，税负较高。例如，同样100万元含税价，普票成本为103万元。

3. 适用场景

   • 专票 ：适用于需长期合作、可抵扣进项税的供应商，尤其一般纳税人企业。

   • 普票 ：适用于小规模纳税人或供应商无法提供专票的情况。

三、注意事项

• 供应商资质 ：需确认供应商是否为一般纳税人，否则专票可能无法抵扣。

• 价格约定 ：若双方约定含税价结算，专票和普票成本差异更明显。

一般纳税人企业应优先选择专票以降低税负，但需结合供应商资质和合同条款综合判断。