会计档案合并后的保管规定如下：

一、合并后单位存续的情况

1. 统一保管 ：若合并后原单位均存续，各单位的会计档案仍由原单位各自保管，无需合并。

2. 档案整合 ：合并前需对原有会计档案进行整理、汇总，确保数据完整性和准确性，并制定专项管理制度保障档案安全。

二、合并后单位解散的情况

1. 统一归集 ：若合并后原单位中仅一方存续，其他方解散，则解散方的会计档案由存续方统一保管。

2. 档案移交 ：若涉及国有资产，需按《国有企业资产与产权变动档案处置暂行办法》执行，可能移交新设企业或指定单位代管。

三、特殊情形处理

• 分立与业务移交 ：若合并过程中涉及分立或业务移交，未结清事项的凭证需单独保存并交接，相关档案由承接方保管。

• 档案销毁 ：合并后原单位均解散的情况下，档案不得销毁，必须由存续方统一保管。

四、监督与责任

• 会计档案移交或保管需由档案机构、原单位及业务相关方共同监交，确保档案封装完整、责任明确。

• 任何单位和个人不得擅自涂改、拆封或销毁会计档案。