​​新农合多次住院费用超过5万元时，可享受分段报销：5万元以内部分报销50%，超过5万元部分报销60%，且年度累计报销金额通常不设上限​​。这一政策旨在通过大病保险二次报销机制，进一步减轻农民高额医疗费用的负担。

1. ​​报销比例与分段计算​​
   当参保人年度内多次住院的自付费用累计超过起付线（通常为上年度居民人均可支配收入）后，超出的部分进入大病保险报销范围。例如，若累计自付费用为8万元，其中5万元按50%报销（2.5万元），剩余3万元按60%报销（1.8万元），总计可报销4.3万元。

2. ​​起付线与地区差异​​
   起付线标准由各地政府制定，经济发达地区可能更高。例如，部分省份将起付线设为1万元，超出部分才适用分段报销。报销比例也可能因地方财政调整，如经济困难地区对5万元以上部分提高至70%。

3. ​​报销流程与材料​​
   申请二次报销需提供住院发票、费用清单、出院小结及医保卡等材料，通过定点医院或医保经办机构提交。异地就医需提前备案，出院后3个月内完成报销手续。

4. ​​特殊群体与补充保障​​
   低保户、五保户等困难群体可能享受零起付或更高比例报销。部分地区对重大疾病（如癌症）额外提高10%-20%的报销比例，或提供年度保底补偿（如实际报销不足30%时按30%补足）。

​​提示​​：具体报销政策可能随年度调整，建议参保人定期咨询当地医保部门，并保留完整就医凭证以确保权益。结合商业医疗保险可进一步降低医疗费用风险。