住院费用不算门诊起付线，两者是医保报销中独立计算的部分。门诊起付线按年度累计，而住院起付线通常按次或按金额计算，具体标准因地区和政策而异。以下是关键点解析：

1. 起付线机制不同
   门诊起付线为年度累计，当年门诊费用达到规定额度后，超出部分才可报销；住院起付线则按每次住院或年度住院总金额单独计算，不与门诊费用混合。例如，北京职工医保门诊起付线为1800元/年，住院为1300元/次。

2. 报销比例与范围差异
   门诊报销比例较低且有限额，通常仅覆盖医保目录内部分费用；住院报销比例更高（可达80%-90%），且涵盖药品、检查、床位等更广范围。住院费用即使未达起付线，也不会影响门诊报销资格。

3. 基层医疗机构特殊政策
   部分地区对乡镇卫生院等基层医疗机构门诊实行零起付线，但住院仍需按标准计算。这类政策旨在鼓励分级诊疗，减轻常见病门诊负担。

总结：合理规划就医方式可优化医保报销。若需频繁门诊，优先选择基层医院；大额治疗建议住院以享受更高比例报销。具体规则需咨询当地医保部门。