根据权威信息源，退税申报方式的选择需结合收入结构、操作便捷性及政策优化需求，具体建议如下：

一、综合所得年度自行申报（推荐）

1. 适用场景

   • 收入来源复杂（含工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费）或扣除项目较多（如专项附加扣除、子女教育、住房**等）。

   • 需精准计算退税金额或存在多项退税项目（如个人养老金、税优健康险）。

2. 优势

   • 灵活性高，可自主调整申报时间，避免信息遗漏。

   • 通过个税APP试算功能，可动态对比“合并计税”与“单独计税”对年终奖的影响，选择最优方案。

3. 注意事项

   • 需提前核对全年收入、扣除项目及专项附加扣除，确保信息准确。

   • 若存在未申报的退税项目（如2024年生育医疗费），可通过个税APP补申报。

二、通过扣缴义务人申报（推荐）

1. 适用场景

   • 收入单一（主要为工资薪金），且扣缴义务人能准确掌握收入及扣除信息。

   • 缺乏税务知识或操作时间有限，希望省心省力。

2. 优势

   • 操作简便，由单位代扣代缴，减少申报错误风险。

   • 适用于房贷专项附加扣除，系统可自动预填相关数据。

3. 注意事项

   • 部分扣除项目（如子女教育、租房）需自行申报，需额外准备材料。

   • 若单位未准确预填数据，可能影响退税金额。

三、关键优化技巧

1. 年终奖计税方式

   • 分别计算“合并计税”与“单独计税”两种方式的税额，选择退税更多的一种。

2. 专项附加扣除

   • 夫妻双方可协商由高收入方抵扣子女教育、住房**等专项附加扣除。

   • 确保申报时填写完整，避免遗漏（如生育医疗费、子女教育支出）。

3. 退税时效

   • 未申报的退税可通过个税APP在次年3-6月补申报，逾期无法操作。

四、总结建议

• 收入复杂/需精准退税 ：优先选择综合所得年度自行申报。

• 收入单一/操作不便 ：通过扣缴义务人申报更省心。

• 灵活调整 ：利用个税APP试算功能优化申报方案。