灵活就业人员停保后可能会被扣钱，原因主要包括未及时结清欠费、政策性调整以及断缴带来的影响。以下从三个方面进行详细分析：

1. 未及时结清欠费

灵活就业人员如果因资金不足或其他原因导致社保费用连续欠缴，社保机构将停止核定缴费信息，并暂停相关待遇。例如，根据相关政策，连续三个月社保费用扣缴失败后，第四个月起社保机构将停止核定，参保人需补缴欠费后才能恢复参保。

2. 政策性调整

政策性调整也可能导致扣费。例如，《广东省灵活就业人员参加失业保险办法》规定，灵活就业人员参加失业保险后，若因政策变化需调整缴费基数或比例，未及时调整可能导致欠费。

3. 断缴带来的影响

断缴后，灵活就业人员将无法享受相关社保待遇。例如，中断缴费4个月以上，重新参保后需重新计算待遇享受等待期，可能影响医疗报销、养老金领取等权益。

总结

灵活就业人员停保后扣钱的原因复杂，需及时关注政策调整，确保缴费信息准确无误。建议定期查询社保账户状态，避免因欠费影响个人权益。