分公司的增值税由总公司统一申报是可行的，但需满足特定条件。

当企业设立分公司时，增值税的申报主体可以是总公司，但这通常基于以下几种情况：

1. 汇总纳税：总公司和分公司被认定为汇总纳税企业。在此模式下，总公司会汇总计算所有分公司的增值税，并进行统一申报和缴纳。这种方式简化了税收管理，但需要满足国家税务总局的相关规定。

2. 授权委托：分公司可以授权委托总公司代为办理增值税申报事宜。这种情况下，总公司作为代理人，代表分公司完成增值税的计算、申报和缴纳工作。这需要分公司与总公司之间有明确的授权委托协议，并符合税法的相关规定。

3. 特殊行业规定：某些特殊行业或企业集团，根据国家税务总局的特别规定，允许总公司统一申报所有分公司的增值税。这种情况下，总公司需要按照规定的程序和要求进行操作。

在实际操作中，企业应根据自身的组织结构和业务特点，选择合适的增值税申报方式。如果选择由总公司统一申报，企业需要确保符合相关税法规定，并建立健全的内部控制制度，以确保增值税申报的准确性和合规性。

总结：分公司的增值税由总公司申报在特定条件下是允许的，包括汇总纳税、授权委托和特殊行业规定等情况。企业应根据自身情况选择合适的申报方式，并确保符合税法规定。