聘任制公务员和合同工的核心区别在于身份性质、法律适用及保障体系：前者属于编制内特殊公务员岗位，受《公务员法》约束且享有财政保障；后者为普通劳动合同关系，适用《劳动法》且权益依赖企业协议。

1. 身份与编制
   聘任制公务员占用机关编制，针对专业性强的岗位设立，虽为合同聘用但属于公务员序列；合同工则完全脱离编制体系，属于企业或单位的临时或辅助性员工，无公务员身份。

2. 法律依据与保障
   聘任制公务员受《公务员法》管理，享受国家财政支付的工资、退休金及公务员福利；合同工劳动关系由《劳动合同法》规范，薪资福利由企业自主决定，稳定性较低。

3. 岗位特性与任期
   聘任制公务员通常为高技术需求或特殊职能岗位，合同期明确且可能续聘；合同工岗位灵活，期限和内容由双方协商，但解约风险较高。

理解两者差异有助于职业选择：聘任制公务员适合追求稳定与专业发展的群体，而合同工更适合灵活就业或短期过渡。