公务员因旷工被开除是合法的，但需符合法定程序和条件。根据相关法律法规，具体分析如下：

一、开除的合法性依据

1. 《公务员法》规定

   公务员旷工或因公外出、请假期满无正当理由逾期不归，连续超过十五天，或一年内累计超过三十天的，予以辞退。

2. 《公职人员政务处分法》规定

   连续旷工超过十五天或一年内累计超过三十天的，给予开除处分。

二、特殊情形的例外规定

• 不得辞退的情形 ：因公致残、患病或负伤在医疗期内、女性公务员在孕期、产假、哺乳期内等。

三、程序要求

1. 调查与确认 ：需经过单位调查核实旷工事实，确认是否存在无正当理由逾期不归的情况。

2. 书面处分 ：以书面形式作出政务处分决定，明确告知公务员权利救济途径。

3. 档案与保险处理 ：依法办理工作交接和保险转移手续，因旷工直接开除不涉及经济赔偿。

四、与普通员工的区别

• 无经济赔偿 ：公务员因自身过错被开除，单位无需支付经济补偿金。

• 政务处分影响 ：开除属于最严重政务处分，可能影响晋升、薪资待遇等。

公务员旷工被开除在符合法律规定的前提下是合法行为，但需严格遵循法定程序，并注意区分因公致残等特殊情形。