打架双方自行调解后通常不会立案，但需视具体情况而定。

1. 和解协议的效力： 如果打架双方在事发后达成和解协议，并能够自行解决纠纷，通常情况下，警方会尊重双方的意愿，不再对案件进行立案侦查。这是因为和解协议在法律上被视为双方对争议的自愿解决，表明他们已经就赔偿、道歉等问题达成一致。

2. 警方的处理原则： 警方在处理打架斗殴案件时，一般会遵循“调解优先、处罚为辅”的原则。如果双方能够通过自行调解解决问题，警方通常会鼓励并协助他们达成和解，以避免不必要的法律程序和资源浪费。

3. 法律规定的限制： 并非所有打架案件都适合自行调解。根据法律规定，如果打架行为涉嫌违反治安管理处罚法或刑法，如造成严重伤害、使用危险武器等，警方仍需依法立案侦查，并根据调查结果追究相关人员的法律责任。

4. 和解协议的执行： 即使双方达成和解协议，如果一方未能按照协议履行义务，如拒绝支付赔偿金或继续威胁、骚扰对方，警方仍可能介入并采取相应措施，以维护法律的尊严和当事人的合法权益。

总结：打架双方自行调解后通常不会立案，但需满足一定的条件，如双方自愿达成和解协议、不涉嫌严重违法行为等。如果无法满足这些条件，警方仍可能依法立案侦查。在处理打架纠纷时，建议双方尽量通过合法途径解决问题，以避免不必要的法律风险。