‌医保卡余额不会自动用于缴纳社保费用‌，这是两个独立的账户系统。医保账户资金专款专用，主要用于医疗费用报销和个人购药；而社保缴费需通过单位代扣或个人主动缴纳。不过部分地区已实现家庭共济账户自动扣缴"一老一小"医保费用，但这与社保缴费性质不同。

主要区别体现在三方面：

1. ‌账户性质不同‌
   医保个人账户资金归个人支配，社保缴费属于法定义务。医保卡余额本质是医疗专用资金，不能抵扣养老、失业等其他社保险种费用。灵活就业人员即便绑定银行卡自动扣社保，扣款来源也非医保账户。

2. ‌资金流向明确‌
   职工医保账户余额实行年度结转制度，未使用完的资金自动累积至次年。而社保缴费资金直接进入统筹池，不存在"预存抵扣"机制。城乡居民医保由于不设个人账户，更不存在余额转社保的可能。

3. ‌政策趋势变化‌
   2025年新规显示，虽然社保医保经办窗口逐步合并，但缴费仍保持独立性。灵活就业人员在多数省份仍可单独缴纳医保，无需强制绑定社保。北京等地的家庭共济账户自动扣款仅针对亲属医保缴费，与社保无关。

需要特别注意的是：若听说"医保余额可缴社保"的传言，通常是对"社保卡金融功能"的误解。社保卡虽兼具银行账户，但存入该账户的钱与医保余额分属不同系统，只有事先办理代扣协议才会触发自动缴费。建议通过官方渠道办理社保缴费，确保权益记录准确无误。