事业单位合同制员工权益保护主要通过法律规范、制度建设和监督机制实现，具体措施如下：

一、核心权益保障

1. 劳动合同规范

   • 合同签订需明确工资、工时、休息休假等核心条款，保障双方权利义务。

   • 单位不得随意解除合同，需符合法定情形（如连续旷工、年度考核不合格等）。

2. 工资与福利保障

   • 工资按时足额发放，加班需支付加班费，薪酬与绩效、市场水平挂钩。

   • 依法缴纳五险一金，提供带薪年假、探亲假等法定休假。

3. 劳动保护与安全

   • 提供符合安全标准的工作环境及必要劳动保护用品，保障人身安全。

二、争议处理机制

• 建立劳动争议调解、仲裁和诉讼支持体系，确保纠纷解决效率。

• 单位需设立专门机构处理员工诉求，加强劳动监察。

三、制度与监督措施

1. 招聘与合同管理

   • 规范招聘流程，确保公开公平，合同内容需经社会监督。

   • 完善合同变更、解除程序，明确补偿标准。

2. 动态调整与监督

   • 薪酬随经济发展水平调整，防止平均主义。

   • 定期开展劳动监察，保障合同履行合规性。

四、法律赋予的特殊权利

• 连续工作满10年或两次续签固定期合同后，可要求签订无固定期合同。

• 劳动纠纷可通过诉讼**，单位不得以社保缴纳情况限制员工流动。