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税务局会检查发票作废情况，具体如下：

一、税务检查的依据与风险

1. 系统监控与风险预警

   税务局通过“现金税四期+增值税风险防控预警系统+大数据”实时监控发票使用情况。若发现大额或异常作废发票（如某月突然大量作废），可能怀疑企业存在收入隐瞒或偷税行为，从而展开调查。

2. 相关法规要求

   根据《中华人民共和国发票管理办法》，发票作废需符合法定情形（如购买方拒收、开票有误等），且需在30日内办理作废手续。未按规定作废的发票可能被认定为违规，面临补缴税款、加收滞纳金、罚款等处罚，严重者可能移送司法机关。

二、发票作废的查询方式

1. 国家税务总局平台

   通过国家税务总局官网的发票查验系统，可查询发票是否作废。若发票已作废，系统会显示“作废”字样。

2. 地方税务机关查询

   可登录当地税务机关官网或拨打12366热线查询，或前往发票开具单位核实。

3. 线下查询

   直接联系发票发行企业，提供相关凭证核实发票作废状态。

三、高风险情形与注意事项

1. 作废发票异常情况

   • 突然大量作废

   • 多张空白发票作废

   • 进项与销项严重不匹配

   • 同一笔销售发票当月多次作废/次月重开

2. 税务核查重点

   税务部门可能通过企业财务报表、现金流量、发票领用记录等综合判断。若发现作废发票与经营业务不符，可能触发稽查。

3. 规范建议

   • 保留作废发票存根联完整记录

   • 避免频繁作废，确需作废时及时在系统中操作

   • 定期进行税务自查，确保发票管理合规。

四、违规后果

• 补缴税款与滞纳金 ：需补缴应纳税款并加收滞纳金；

• 罚款 ：根据情节轻重，可能被处以数万元罚款；

• 信用影响 ：被列入税收违法记录，影响企业信用评级；

• 法律责任 ：涉及虚开发票等犯罪行为的，可能被移送司法机关追究刑事责任。

企业应规范发票管理，避免因作废发票引发税务风险。若已发现异常，建议及时整改并咨询专业税务机构。