​​非独立核算分公司需要申报个人所得税，且必须依法完成税务登记和申报流程，即使由总公司代扣代缴也需经税务机关批准。​​

1. ​​税务登记与申报义务​​
   无论是否独立核算，分公司在取得营业执照后30日内需办理税务登记（“三证合一”除外）。若税务机关核定了个人所得税税种，则必须申报，长期零申报可能引发税务风险。

2. ​​总公司代扣代缴的例外情况​​
   总公司代扣个税需经主管税务机关批准，但分公司仍需在属地完成申报。例如，工资由分公司发放的，需在分支机构所在地缴纳；跨省施工企业则需在工程所在地申报。

3. ​​非独立核算分公司的两类情形​​

   • ​​无生产经营职能​​：通常仅需零申报增值税等，但个税需按实际申报。
   • ​​有生产经营职能​​：除个税外，还需预缴增值税、所得税（总公司汇总清算），具体比例由税务机关核定。

4. ​​属地管理原则​​
   税务机关按分支机构所在地管辖，若与总公司不在同一区域，个税需单独申报。例如，上海分公司即使非独立核算，也可能被要求独立完成个税申报。

​​提示​​：分公司的税务处理需结合当地政策，建议提前与税务机关沟通，避免因流程疏漏导致处罚。