​​独立核算分公司需按照25%的税率缴纳企业所得税​​，其税务处理与总公司分离，需独立开立扣税账户、计算盈利并申报纳税。​​关键点包括​​：独立核算不得享受小微企业税收优惠、需定期预缴税款、且跨省经营时法定需汇总纳税（特殊规定除外）。

1. ​​税率与核算模式​​：独立核算分公司适用25%的基本税率，无论总公司是否享受优惠（如小微企业5%税率），分支机构均需按独立利润缴纳。若选择汇总纳税，则盈亏可互补，但独立核算模式下需单独承担税负。

2. ​​操作流程​​：需完成扣税账户备案，通过电子系统申报税款，税务机关自动扣缴。按月或按季度预缴，并定期提交税务报表接受检查。

3. ​​限制与例外​​：

   • ​​税收优惠排除​​：分支机构即使符合小微企业标准（如从业人数、资产总额等），也因非法人资格无法独立享受优惠税率。
   • ​​跨省经营强制汇总​​：跨省设立的分公司需强制备案汇总纳税，不可选择独立核算。

​​提示​​：企业应结合经营规模、地域政策及税务合规成本选择核算模式，并咨询专业机构以确保最优税务方案。