独立核算的分公司通常需要与母公司合并纳税，除非满足特定条件才能选择独立纳税。

1. 独立核算分公司的定义

独立核算分公司是指具备独立财务报表、独立银行账户和独立经营决策权的分支机构，但其法律地位仍然从属于母公司，不具备法人资格。

2. 合并纳税的法律依据

根据《企业所得税法》第五十条第二款，居民企业在中国境内设立的不具有法人资格的营业机构（如分公司），应当汇总计算并缴纳企业所得税。这表明，独立核算的分公司通常需要纳入母公司的汇总纳税范围。

3. 特殊情况下的独立纳税

尽管独立核算分公司通常需合并纳税，但某些情况下，分公司可以申请独立纳税。例如：

• 分公司所在地税务机关批准其独立纳税；
• 分公司具有独立法人资格（如子公司）。

4. 合并纳税的流程

合并纳税的分公司需将自身的营业收支情况定期报送至母公司，由母公司统一计算并汇总缴纳企业所得税。分公司还需在当地税务机关进行就地预缴，最终由母公司进行集中清算。

5. 税务管理的注意事项

• 增值税：无论是否独立核算，分公司的增值税一般需在所在地缴纳，除非申请汇总纳税。
• 其他税种：如财产和行为税等，可能需要根据当地税务机关的具体要求进行申报。

6. 政策变化的影响

需要注意的是，2008年《企业所得税法》实施后，企业所得税的纳税人以法人为标准，而非是否独立核算。独立核算的分公司仍需根据母公司的税务安排进行汇总纳税。

总结

独立核算的分公司是否需要合并纳税，取决于具体税务政策及分公司的实际情况。一般情况下，分公司需纳入母公司汇总纳税范围，但也可在满足特定条件下申请独立纳税。企业在税务管理中需关注政策变化，并确保合规操作，以降低税务风险。