事业单位员工因病旷工被辞退是否有赔偿，需分情况讨论：若因病情导致旷工且医疗期未满，单位解除合同属违法，需支付赔偿金；若医疗期满后仍无法工作且单位已合理调岗，则合法解除但需支付经济补偿；若属无故旷工（如未提供病假证明），单位可无补偿解除合同。

1. 医疗期内的保护
   根据《劳动合同法》，员工患病或非因工负伤时享有医疗期，期间单位不得解除劳动合同，否则需按双倍经济补偿标准支付赔偿金。例如，医疗期内员工因病无法到岗并提供有效证明的，单位辞退属违法行为。

2. 医疗期满后的处理
   若医疗期结束员工仍无法胜任原岗位，单位需先调岗或培训；若仍无法工作，可提前30天书面通知或支付一个月工资后解除合同，但需支付经济补偿（按工作年限折算）及医疗补助费（不低于6个月工资）。

3. 无正当理由旷工的后果
   员工未提供病假证明且连续旷工超15天（或年累计超30天），事业单位可依据规章制度解除合同且无需补偿。但若单位未明确旷工条款或程序违规，员工仍可主张权益。

总结：赔偿与否关键看旷工是否与病情相关、医疗期是否届满及单位操作合法性。员工应保留病假证明等证据，单位则需规范流程以避免法律风险。