根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国道路交通安全法》相关规定，公司禁止员工开车上班的行为是否合法需分情况讨论：

一、一般情况不合法

1. 劳动权益保障

   员工选择交通工具上班属于个人自由，公司不得强制干涉。若公司强制要求员工乘坐通勤车或禁止使用私家车，可能构成变相加班或侵犯劳动自主权。

2. 法律依据

   《劳动法》第三十一条规定，用人单位不得强迫或变相****者加班。若公司通过限制交通方式变相延长工作时间，可能违反该规定。

二、特殊情形可能合法

1. 安全风险较高时

   若公司能证明员工驾驶车辆存在严重安全隐患（如未投保、驾驶资质不全等），可制定合理的安全规定。但此类规定需与员工协商一致，并明确告知法律依据。

2. 行业特殊要求

   某些高危行业（如建筑、化工等）可能因生产需要制定严格交通限制，但需符合劳动法关于加班审批的规定。

三、**建议

1. 协商解决

   若公司规定不合理，可要求提供班车服务或打车补助，或与管理层协商调整。

2. 法律途径

   若遭遇强制措施，可向劳动监察部门投诉，或通过劳动仲裁主张权益。例如，某水泥公司因禁止员工骑摩托车上班被仲裁支持赔偿请求。

总结 ：公司禁止员工开车上班在一般情况下不合法，但若涉及安全风险或行业特殊需求且依法依规制定，可能被认可。建议优先通过协商解决，必要时寻求法律救济。