公司未给员工申报个税时，补申报的核心流程包括：核实漏缴情况、计算税款及滞纳金、通过电子或线下渠道提交材料、完成缴税并保存凭证。 以下是具体操作步骤：

1. 核实漏缴信息
   确认未申报的具体月份、员工收入数据及应纳税额，确保基础信息准确。需整理员工工资明细、个税计算表等资料，作为补报依据。

2. 计算应补税款与滞纳金
   根据税法规定，补缴税款需加收每日万分之五的滞纳金。公式为：

   $$滞纳金=应纳税额×0.05$$

   若金额较大或逾期较久，建议提前与税务部门沟通减免可能性。

3. 选择补报方式

   • 电子渠道：通过自然人电子税务局或扣缴客户端补报，填写申报表后在线提交。
   • 线下办理：携带税务登记证、公章、申报表等材料至办税大厅，由工作人员协助录入系统。

4. 缴纳税款并留存凭证
   补缴完成后，需取得完税证明并归档，同时通知员工更新个税记录。若涉及跨年补报，还需调整员工个税APP中的专项扣除信息。

及时补报可避免罚款，但需注意逾期时间越长，滞纳金负担越重。建议企业定期核查个税申报情况，确保合规。