咨询费收入达到1000万时，需缴纳的税款主要包括增值税、附加税以及企业所得税。 对于一般纳税人而言，增值税为6%，加上城市维护建设税、教育费附加等附加税，综合税率约为6.78%；假设没有可抵扣的成本费用，企业所得税按25%计算，最终税后净收入将显著减少。

对于咨询服务收入，根据现行税收政策，应缴纳增值税。如果该企业是一般纳税人，则适用6%的增值税率。基于1000万元的收入，增值税额大约为60万元（1000万 * 6%）。还需按照实际缴纳的增值税金额来支付附加税，包括城市维护建设税（市区7%，郊区可能有所不同）、教育费附加（3%）及地方教育费附加（2%），合计约12%的附加税率。这意味着，除了增值税外，还需额外支付约7.2万元（60万 * 12%）作为附加税。

企业所得税是另一大项支出。在扣除上述流转税后，剩余部分需按照企业所得税法规定进行申报纳税。若无其他成本费用可以扣除，理论上应按照25%的企业所得税率计算。这意味着，在扣除增值税和附加税之后，剩余的932.8万元（1000万 - 60万 - 7.2万）将作为应税所得，据此计算的企业所得税约为233.2万元（932.8万 * 25%）。

值得注意的是，上述计算并未考虑任何可能存在的税收优惠政策或减免措施。例如，某些地区为了鼓励特定行业的发展，可能会提供一定的税收优惠，如降低税率或是给予一定比例的退税等。企业在日常运营过程中发生的合理且合法的成本费用也可以用于抵减应税所得，从而进一步减少应缴税款。

当咨询公司获得1000万元的咨询费收入时，除去增值税及其附加税之外，还需承担相当数额的企业所得税。通过合理的税务筹划与利用国家提供的各项税收优惠政策，企业可以在法律允许的范围内有效减轻自身的税负压力，提高税后利润水平。确保所有财务记录准确无误，并及时向相关部门报税，有助于维持良好的商业信誉并避免潜在的法律风险。