村卫生室人员工资的负担主体主要分为以下三部分，具体如下：

1. 村集体承担基础工资

   村卫生室作为基层医疗机构，其行政、人员、业务等由村集体统一管理。村集体需承担基础工资部分，确保人员基本生活保障。

2. 财政补助作为主要收入来源

   • 基本公共卫生服务 ：通过政府购买服务方式，按考核结果拨付经费，用于支付村医绩效工资。

   • 定向补助 ：对实施基本药物制度的村卫生室，中央及地方财政提供定额补助（如高海拔地区可达1万元/个）。

   • 诊疗费补助 ：新农合定点村卫生室收取的诊疗费，经医保基金结算后部分用于绩效工资。

3. 村卫生室业务收入补充

   村卫生室通过诊疗服务收取的收入，在扣除药品、材料等成本后，剩余部分可参与绩效分配。但乡镇卫生院不得无故扣留医疗收入。

法律依据 ：根据《工资支付暂行规定》，工资需以法定货币支付，且用人单位（村卫生室或村集体）应书面记录支付明细。当前政策已明确村医纳入镇卫生院管理体系，享受稳定工资待遇。

总结 ：村卫生室人员工资由村集体、财政补助及业务收入共同承担，其中财政补助是主要来源，乡镇卫生院不得违规扣款。