自建房不动产权证办理的核心流程包括申请提交、材料审核、税费缴纳和证书领取四个关键步骤，需准备身份证、土地权属证明等材料，全程约30个工作日完成。

1. 申请提交
   携带身份证、户口本、土地权属证明（如村委会出具的宅基地材料）等，前往当地不动产登记中心提交申请。材料初审通过后进入受理环节，若材料不全需补正。

2. 权属审核与实地核查
   登记部门核查土地及房屋权属来源的真实性，可能实地查看房屋位置、面积等信息，确保与申请材料一致。此环节通常与税费计算同步进行。

3. 税费缴纳
   根据房屋性质、面积等缴纳契税（如成交价的3%）、登记费（约550元）等费用，可通过自助系统或柜台办理，保留缴费凭证以备领证。

4. 领取证书
   审核通过并缴费后，登记机构将信息录入登记簿，30个工作日内发放证书。本人凭身份证领取，代领需提供委托书及双方证件原件。

办理时需注意材料齐全、税费预算及办理时效，提前咨询当地政策可避免延误。若遇复杂权属问题，建议寻求专业法律协助。