事业单位合并审计通常由国家审计机关或具有资质的社会审计机构负责，具体由主管部门或合并方案审批单位指定。审计的主要内容包括资产核实、财务状况评估以及合规性审查，以确保合并过程的合法性和资产安全。

一、审计的主要流程

1. 资产核实：审计单位对合并双方单位的资产进行全面盘点，确保资产的真实性和完整性。
2. 财务状况评估：审查双方的财务报表，分析财务风险，评估合并后的财务状况。
3. 合规性审查：检查合并过程中是否符合相关法律法规及政策要求，特别是国有资产管理和财务管理的相关规定。

二、审计单位的选择

1. 国家审计机关：具有权威性和独立性，适用于涉及重大资产或敏感领域的合并。
2. 社会审计机构：需具备相关资质，并经主管部门批准，适用于一般性合并审计。

三、审计的关键法规依据

1. 《事业单位财务规则》：规范事业单位财务行为，明确财务审计的重要性。
2. 《中华人民共和国审计法》：规定审计机关的职责和权限，确保审计工作的合法性。
3. 国有资产管理的相关政策：确保合并过程中国有资产的安全和有效利用。

四、审计结果的应用

审计结果将作为合并方案审批的重要依据，用于指导合并后的财务管理、资产整合及运营规划。审计报告还需报送主管部门备案，确保合并过程的透明性和规范性。

五、总结与提示

事业单位合并审计是确保合并合法性和资产安全的重要环节，需严格按照法律法规和政策执行。建议在合并前充分了解相关法规，选择合适的审计单位，并积极配合审计工作，以顺利完成合并过程。