工程审计不合理时，可以通过申诉、沟通与核实等方式解决。以下为具体步骤和注意事项：

1. 明确申诉流程

• 提出异议：对审计结果不服时，应首先向审计单位提出书面异议，说明不合理之处及依据。
• 申请复核：若初步沟通无果，可申请由第三方权威机构进行复核，确保审计结果的公正性。

2. 提供充分依据

• 准备材料：收集合同条款、工程量清单、现场签证等原始文件，证明审计结果与实际情况不符。
• 引用法规：依据国家及地方相关法规，说明审计过程中可能存在的违规行为。

3. 沟通技巧

• 倾听与表达：与审计单位充分沟通，听取其意见，同时清晰表达自己的立场和诉求。
• 避免冲突：在沟通过程中保持冷静，避免情绪化表达，以免影响问题解决。

4. 寻求专业帮助

• 咨询律师：必要时，可寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自身权益。
• 联系行业协会：向相关行业协会反映问题，寻求行业内的协调与支持。

5. 持续跟进

• 记录沟通内容：每次沟通后，记录关键信息，以便后续跟进。
• 关注进展：定期与审计单位或第三方复核机构联系，了解问题处理进度。

通过以上步骤，可有效应对工程审计不合理的问题，保障自身权益。