工程款支付不能以审计未完成作为拒付理由，核心法律依据包括：实际施工人起诉权不受审计限制、审计非法定前置条件、合同约定优先于行政审计程序。

1. 实际施工人权利保障
   即使未签订书面合同或审计未完成，只要存在施工事实且工程验收合格，施工方即可通过诉讼主张工程款。法院应依据证据规则或工程鉴定确认欠款事实，不得以程序问题驳回起诉。

2. 审计程序与付款义务分离
   政府审计属于行政监督行为，除非合同明确约定以审计结果为结算依据，否则发包方不得以此拖延付款。最高法明确强调，审计拖延不能成为拒付抗辩理由，工程款支付应遵循合同约定或法定结算标准。

3. 法律明文禁止审计捆绑支付
   《保障中小企业款项支付条例》等规定严禁强制要求以审计结果作为结算依据，地方性法规中类似条款因限制民事权利已被要求纠正。国有工程若以审计未完成为由拖欠款项，可能面临产权登记限制等行政措施。

总结：工程款支付应以合同履行和事实认定为优先，审计程序仅作为监管手段，而非付款前提。施工方遇拖欠时可直接起诉，无需等待审计结论。