​​劳务公司扣除个人所得税但未申报属于违法行为，可能导致补税、滞纳金、罚款甚至刑事责任。​​关键风险包括：企业面临最高5倍逃税罚款、农民工工资无法税前扣除、个人信用受损，而​​补救核心是立即补报并留存“四流合一”证据链​​。

1. ​​法律后果​​
   企业未申报已扣个税，税务机关可追缴税款并按日加收0.05%滞纳金，同时处以应扣未扣税款50%-5倍罚款。若构成逃税罪（如逃税额超应纳税额10%），责任人将面临3年以下刑期；超过30%则刑期升至3-7年。个人若未主动申报，可能被处2000-1万元罚款。

2. ​​税前扣除风险​​
   建筑劳务公司未申报农民工个税，其工资支出会被视为“不合规凭证”，导致企业所得税前扣除资格丧失。需补缴25%企业所得税及滞纳金，典型案例中企业因6000万元未申报工资被罚2250万元。

3. ​​补救措施​​

• ​​立即补报​​：通过自然人电子税务局补报（可追溯5年），同步提交工资表、银行流水、用工合同等凭证；
• ​​协商或举报​​：若劳务公司拒不配合，可向税务机关举报并提供扣税记录、沟通证据；
• ​​零申报合规​​：即使收入未达起征点，也需完成个税零申报，避免被认定为未履行义务。

4. ​​证据留存要点​​
   用工形式不同，所需凭证各异：

• ​​直接雇佣​​：保留工资表+个税申报记录+考勤表；
• ​​劳务派遣​​：需劳务发票+派遣协议+结算单；
• ​​包工头承包​​：必须取得代开发票+工程量清单。

​​提示​​：企业应定期自查个税申报情况，避免因“侥幸心理”触发稽查。个人若发现被扣税未申报，需在30日内督促公司处理，否则可能承担连带责任。