根据最新政策及权威信息，历史遗留违章建筑的处理办法可归纳为以下四点：

一、处理原则与主体

1. 依法依规处理 ：由县级以上城乡规划主管部门或乡镇人民政府负责认定，法院无权直接作出处理决定。

2. 分类处理 ：根据建筑性质、影响程度及权属情况，采取补办手续、罚款、限期拆除等不同方式。

二、核心处理措施

1. 登记确权与增税约束

   • 允许存量违法建筑办理不动产登记，明确产权边界，保障合法使用权益。

   • 增加纳税义务，通过经济手段抑制新增违法建设。

2. 补办手续合法化

   • 对具有历史文化价值或实际需求的建筑，允许补办用地、规划手续，实现合法化。

   • 农村地区试点推行“三调”（调查、认定、处理）模式，分类分步处置存量违法用地。

3. 多样化处罚方式

   • 除拆除外，还可采取罚款、限期改正等，优先保障建筑安全与公共利益。

三、特殊情形处理

1. 历史建筑保护 ：因历史、文化或生活需要，对符合规划的建筑允许保留。

2. 权属争议处理 ：通过调查确认权属，避免****。

四、政策导向

当前政策强调“管住新增、遏制增量”，重点解决农村乱占耕地建房问题，试点区域采取宽严相济原则，平衡公共利益与居民权益。