合同条款变更的法律程序主要遵循协商一致原则，具体分为以下五个步骤：

一、提出变更请求

1. 书面通知

   变更方需以书面形式（如函件、邮件等）明确说明变更理由、内容及生效条件，并设定合理答复期限。例如《工矿产品购销合同条例》规定，变更通知需在15日内答复，逾期视为默认。

二、对方答复与协商

2. 书面答复

   受理方需在指定期限内书面回应，同意或拒绝变更。若逾期未答复，根据《民法典》第五百四十三条，视为默认同意变更。

3. 协商一致

   双方就变更条款进行谈判，达成一致后形成书面协议，明确新条款内容及生效日期，并由双方签字盖章。

三、备案或鉴证（如需）

4. 法定程序

   • 经备案或鉴证的合同，变更协议需提交原主管部门备案或重新鉴证，否则不生效。

   • 例如《合同法》规定，因重大误解、欺诈等情形变更的合同，可请求法院或仲裁机构强制变更。

四、履行内部审批（企业合同）

5. 企业内部流程

   重大合同变更需经股东会、董事会决议，或履行国资监管、信息披露等程序，并保存相关文件作为合法性依据。

五、法律效力

变更后的合同与原合同具有同等法律效力，原合同条款自变更协议生效之日起废止。变更协议作为双方新约定，与原合同冲突时以变更协议为准。

法律依据 ：《民法典》第七十七条规定，合同变更需协商一致，法律、行政法规另有规定的除外。