企业补缴社保费用的责任主体通常由用人单位承担，但需根据断缴原因区分责任：若因单位未履行法定义务导致断缴，则单位需全额补缴（含滞纳金）；若因员工个人原因（如离职未及时转移社保），则费用可能由员工自行承担。

1. 用人单位责任
   根据《社会保险法》，企业应在员工入职30日内办理社保登记并缴费。若因企业漏缴、少缴或经营困难拖欠费用，补缴费用及滞纳金均由企业承担。例如，企业扣留员工个人缴费部分却未代缴的，差额需全额补足。

2. 员工个人责任
   员工主动离职且未及时办理社保转移，或明确放弃参保的，后续补缴费用需自行承担。但若企业未履行告知义务或存在操作失误，仍可能被要求分担责任。

3. 争议解决途径
   双方对责任归属存在争议时，可向劳动监察部门投诉或申请仲裁，需提供劳动合同、工资流水等证据。特殊情况下（如不可抗力），可能协商分担费用。

总结：补缴责任的核心在于“过错方判定”，企业应规范社保管理，员工需关注缴费记录，争议时优先通过法律途径解决。