历史遗留宅基地纠纷可以通过‌协商调解、行政处理、司法诉讼‌三种主要途径解决，关键在于‌确权依据充分、程序合法合规、兼顾历史与现实因素‌。以下是具体处理方式：

1. ‌协商调解优先‌
   当事人可自行协商或通过村委会、人民调解委员会介入，达成书面协议后向法院申请司法确认。调解方案需结合宅基地使用现状、历史成因及双方利益平衡，尤其注重维护长期实际使用者的合法权益。

2. ‌申请行政确权‌
   向县级自然资源部门提交权属争议处理申请，需提供：

   • 土改证、宅基地使用证等历史权属证明
   • 村镇规划审批文件
   • 近30年实际使用证据（如房屋修建记录、缴费凭证）
     行政机关将依据《土地管理法》调查核实，作出确权决定。

3. ‌提起确权诉讼‌
   若行政处理未解决争议，可在收到决定书后6个月内提起行政诉讼。法院审理重点包括：

   • 争议地块是否属于集体组织原始分配范围
   • 是否存在违规买卖、超占等无效情形
   • 现有房屋是否符合"一户一宅"政策

处理过程中需注意：1982年《村镇建房用地管理条例》实施前的占用行为、1999年前城镇居民购买的农村宅基地等特殊情形，可能适用不同认定标准。建议同步收集四邻证言、航拍图等辅助证据，必要时咨询专业律师制定**策略。