针对农村一户有两个宅基地的情况，处理方式主要 取决于宅基地的合法性及具体情况 。以下是一些可能的处理办法：

1. 合法的一户两宅 ：

• 分户处理 ：如果是因为分户未分宅导致的一户两宅，可以通过分户处理，使两宅分别对应不同的户头，从而符合“一户一宅”原则。分户后，两处宅基地均可进行确权登记。

• 户口回迁 ：因户口回迁造成的一户多宅，若是因为管理部门的疏忽，这种情况也是合法的，可以进行确权处理。

• 继承 ：因继承房子导致的一户两宅，只要宅基地上的房子不坍塌，继承人可以继续居住和使用，并且依法应当确权登记。

• 宅基地总面积符合当地规定 ：部分区域因地理条件等因素，村民初次所建房子面积狭小，后重新申请宅基地建房，但两次或多次建房的总面积未超过当地政策规定的标准，这种情况下的一户多宅也是合法的，可进行确权登记。

2. 不合法的一户两宅 ：

• 有偿使用 ：一些区域试行村庄宅基地有偿使用政策，若一户两宅中宅基地面积超过当地建筑面积标准，一般不会被强制回收撤除，但需交纳一定费用方可继续居住使用。

• 违法用地 ：如果农村村民拥有两处宅基地，并且房屋的面积都已经达到国家规定的标准，那么其中一处的宅基地很有可能会被农村集体依法回收。

3. 其他处理方式 ：

• 合法转让 ：通过合法转让宅基地，可以使一户两宅合法化。

• 自愿有偿退出 ：农户可以自愿有偿退出多余的宅基地，宅基地归集体所有。

• 缴纳罚款 ：在违法情况下，农户可能需要缴纳一定的罚款，暂时可以居住。

建议

• 了解当地政策 ：在处理一户两宅问题时，首先需要了解当地的具体政策和规定，以便选择最合适的处理方式。

• 咨询专业意见 ：建议咨询当地的法律专家或土地管理部门，确保处理方式合法合规。

• 及时确权登记 ：对于合法的一户多宅，应及时进行确权登记，以保障自己的合法权益。

通过以上分析，可以看出处理一户两个宅基地的问题需要综合考虑多种因素，并遵循相关法律法规和政策规定。