工程预算的归属部门需要根据具体工作场景和部门职能进行区分，主要涉及以下情况：

一、预算编制与管理部门

1. 财务部门

财务部门是工程预算的主要编制和执行部门，负责根据企业战略和经营计划制定资金支出计划，监控预算执行情况，并确保资金有效使用。在工程预算编制中，财务部门需协调工程、物资等相关部门，审核预算方案。

2. 建设部门或工程管理部门

在政府项目或大型企业中，建设部门或工程管理部门可能直接参与预算编制，尤其是涉及基础设施建设项目时。这些部门通常负责项目整体规划，与财务部门协同完成预算编制工作。

二、工程结算与纠纷处理

工程结算纠纷的处理以预算部门为核心，其他部门配合完成。具体流程包括：

• 预算部门审核结算资料的完整性、真实性和合理性；

• 发现问题后通知工程部门整改补充；

• 通过协商或法律途径解决纠纷。

三、其他相关部门

1. 财政部门

财政部门负责政府性基金预算和国有资本经营预算的管理，监督预算执行情况，并对重大投资项目进行宏观管理。

2. 住房城乡建设主管部门

建设工程结算纠纷的最终处理由县级以上地方住房城乡建设主管部门负责，其可委托工程造价管理机构进行具体审核。

总结

工程预算的归属并非单一部门职能，而是多部门协同合作的结果。财务部门为核心编制和执行主体，建设或工程管理部门参与具体项目预算，财政和住建部门在特定场景下承担监管职责。实际操作中需根据组织架构和项目性质确定具体分工。