运输合同管辖权主要依据合同双方当事人的约定和相关法律规定来确定。

运输合同管辖权的规定主要包括以下几点：

1. 约定管辖优先：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖。如果运输合同中明确约定了管辖法院，则应优先按照约定确定管辖权。

2. 法定管辖：在没有约定管辖或约定不明确的情况下，根据《中华人民共和国民事诉讼法》第二十四条的规定，因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。对于运输合同而言，合同履行地通常是指货物的交付地或目的地。

3. 特殊规定：针对一些特殊的运输合同，如海上货物运输合同和航空货物运输合同，相关法律还做出了特别规定。例如，根据《中华人民共和国海事诉讼特别程序法》第六条的规定，因海事侵权行为、海商合同纠纷以及法律规定的其他海事纠纷提起的诉讼，由海事法院管辖。

4. 国际运输合同：对于国际运输合同，管辖权的确定可能涉及国际私法和相关国际公约的规定。例如，《联合国国际货物销售合同公约》规定了国际货物销售合同的管辖权原则，而《海牙规则》和《汉堡规则》等国际公约则对海上货物运输合同的管辖权做出了规定。

总结：运输合同管辖权的确定应首先依据合同双方当事人的约定，在没有约定或约定不明确时，则依据相关法律规定和特殊规定来确定。对于国际运输合同，还可能涉及国际私法和国际公约的规定。在实际操作中，建议合同双方在合同中明确约定管辖法院，以避免潜在的管辖权争议。