运输合同纠纷的管辖权规定主要依据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关法律条款，具体如下：

一、基本原则

1. 优先约定管辖

   若运输合同中明确约定了管辖法院（如运输始发地、目的地或被告住所地），则优先适用该约定。

2. 法定管辖原则

   • 无约定时 ：由运输始发地、目的地或被告住所地法院管辖。 - 履行地确定 ：若合同已履行，以合同履行地法院管辖；若未履行，可约定任一方住所地或合同签订地法院管辖。

二、特殊情形处理

1. 单一运输工具

   • 水运：由海事法院管辖。 - 铁路/公路/航空：由对应运输法院管辖。

2. 联合运输

   • 涉及海事、铁路、水路或航空的，分别由海事法院、铁路运输法院、水上法院或航空运输法院管辖。

三、管辖异议与受理

• 当事人选择管辖法院后，其他法院不得推诿，应依法受理。- 若存在多个有管辖权的法院，当事人只能选择其中一个起诉。

四、法律依据

• 核心条款 ：《民事诉讼法》第24条、第27条、第28条。- 特别规定 ：《海事诉讼特别程序法》对海上运输纠纷有专属管辖。

总结 ：运输合同纠纷管辖以合同约定优先，法定原则为补充，特殊运输工具或联合运输需结合专属管辖规则确定。