税务局与稽查局是上下级关系，稽查局作为税务局的直属机构，执行税务稽查职能，但最终决策权仍在税务局。两者协作中，税务局对稽查局的工作具有监督权，但具体执行需依法依规，并非简单“听从”。

1. 职能定位差异
   税务局负责税收征管、政策制定及纳税服务，而稽查局专司税务违法案件调查，属于税务局的执法延伸部门。稽查局的调查结果需提交税务局审核，后者根据证据链和法律依据作出最终处理决定。

2. 监督与协作机制
   税务局对稽查局的稽查程序、案件定性等有监督权，确保执法合规性。若稽查局存在不作为或程序瑕疵，税务局可要求整改或重新调查，但需避免干预具体案件处理。

3. 案件处理流程
   稽查局在调查中需独立取证，但重大案件（如涉刑）需税务局批准后方可移交司法机关。日常工作中，双方通过联席会议、案件复核等方式保持沟通，但决策层级分明。

总结：税务局与稽查局的关系是监督与执行并存，稽查局的专业意见会被重视，但最终权威仍属税务局。企业遇到稽查时，应配合调查同时关注程序合法性，避免误解两者权责边界。