事业单位副高五级与六级退休工资的差异主要体现在缴费基数、岗位工资差距及任职时间三方面，具体区别如下：

一、在职期间岗位工资差距

1. ‌岗位工资差额‌
   副高五级岗位工资为3405元/月，六级为3005元/月，两者相差400元/月‌。若考虑绩效工资改革后的数据，五级比六级岗位工资差距可能扩大至470元/月‌。

2. ‌社保及公积金缴纳差异‌
   五级岗位的缴费基数更高，导致单位缴纳的养老保险（20%）、职业年金（8%）、住房公积金（12%）等累计每月多160元‌。个人账户累计额因此更高，直接影响退休后个人账户养老金‌。

二、退休金差距的影响因素

1. ‌任职时间长短‌

   • ‌短期晋升‌：临近退休时从六级晋升五级，缴费基数提升时间短，退休金差距可能仅几十元‌。
   • ‌长期任职‌：若在五级岗位工作多年，缴费基数持续较高，退休金差距可达400元/月‌。

2. ‌地方政策差异‌
   部分地区对副高职称的退休补贴政策不同，如绩效工资改革后，五级岗位的基础性绩效和市级增量绩效可能比六级高350元/月，进一步拉大退休金差距‌。

三、与其他岗位的对比

副高五级岗位工资高于正处级公务员（2780元/月），退休金通常也高于正处级管理岗位‌。但与正高级职称相比，副高五级仍存在显著差距‌。

‌总结‌：副高五级与六级退休工资的差距取决于晋升时间、缴费基数累计及地方政策。长期任职五级岗位的退休金可能比六级高400元/月，短期晋升则差距较小‌。