山东省基层副高职称不能进档的原因主要有以下几点：

1. 职称档次设置 ：副高职称通常分为7档（最低档）、6档和5档（最高档），大部分教师在评上副高职称后，其职称档次多为7档，并且一直到退休，并没有进档的机制。

2. 职称进档的限制条件 ：虽然有些地方存在职称的分级竞聘或职称进档的制度，但这些制度通常伴随着一定的条件限制。例如，教师需要在教学、科研等方面取得显著成绩，并且符合相应的晋升标准，才能获得职称进档的机会。

3. 地方政策差异 ：不同地区对于职称进档的规定有所不同。有些地区可能根本就没有副高职称进档的政策，或者进档的标准和程序较为严格，导致教师难以获得职称进档的机会。

综上所述，山东省基层副高职称不能进档的原因主要是职称档次设置、职称进档的限制条件以及地方政策差异等多方面因素共同作用的结果。建议教师在评上副高职称后，积极了解并符合当地的职称进档政策，以争取更多的职业发展机会。