根据最新政策，您在灵活就业期间缴纳的医疗保险与入职新单位后的处理方式如下：

一、处理流程

1. 停缴个人缴费

   需及时向原参保地或新单位申请暂停个人缴纳医保，避免重复缴费。具体操作可通过当地社保局官网、线下窗口或电话咨询办理。

2. 办理医保转移

   • 同一统筹区 ：新单位可直接为您续缴职工医保，个人缴费年限累计计算。

   • 不同统筹区 ：需先办理停保，再通过医保网厅、个人登录或线下窗口办理跨区转移手续。

3. 提交所需材料

   通常需提供身份证复印件、社保卡、缴费证明、劳动合同等材料，具体以新单位要求为准。

二、注意事项

• 缴费年限累计 ：个人缴纳部分和单位缴纳部分均可计入累计缴费年限，影响退休待遇。

• 待遇享受 ：新单位参保后，可正常享受医保报销、门诊等权益。

• 法律依据 ：根据《社会保险法》，用人单位需在用工30日内为您办理参保登记。

三、特殊情况处理

若涉及灵活就业转职工保，需先注销居民医保，再按职工医保流程办理转移。