询证函对方不配合的处理方式需根据具体场景和法律后果采取相应措施，主要分为以下四类：

一、法律强制措施

1. 法院介入

   若对方拒绝履行法院调查取证义务，法院可责令其履行协助，同时处以罚款、拘留；若构成犯罪，依法追究刑事责任。

二、审计程序调整

2. 实施替代审计程序

   注册会计师在未获回函时，需评估其对审计的影响，通过电话、实地考察等替代方式获取证据，并在必要时出具保留或否定审计意见。

三、协商与沟通

3. 加强沟通与协助

   • 确认询证函内容是否清晰，主动联系对方了解不配合原因；

   • 提供必要协助（如文件核对、信息补充），避免因误解导致合作中断。

四、法律追责

4. 追责与诉讼

   • 发送律师函并保留回执，若仍无回应可向会计协会、工商局投诉，甚至向法院起诉；

   • 依据《民事诉讼法》等法律，通过诉讼维护自身权益，需准备律师函、合同等证据。

注意事项 ：处理过程中需注意保护商业秘密，避免因对抗影响长期合作关系。若涉及法律程序，建议咨询专业律师。