税务机关查工资情况主要通过以下方式及重点展开，确保税收合规：

一、核心检查方式

1. 凭证与账实核对

   审核工资花名册、考勤表、工资明细账、银行回单等凭证，核查应付职工薪酬与实付工资是否一致，重点检查补贴、奖金、福利的代扣代缴情况。

2. 数据比对与分析

   • 将企业申报工资与社保、公积金数据对比，分析工资基数与社保缴纳基数的差异；

   • 通过金税三期系统关联银行、社保数据，核查申报人员与实际工资的匹配度。

3. 实地核查与走访

   现场查看考勤记录、工资发放凭证，核实员工人数及薪酬标准，结合企业生产经营情况判断数据真实性。

二、重点关注点

1. 违规发放方式

   • 现金发放无转账记录、私用账户发放工资、虚开发票抵工资等行为易被查处；

   • 工资拆分、隐瞒员工人数以降低社保基数等手段难逃监管。

2. 税务与社保差异

   重点关注工资与个税申报金额、社保缴纳基数的异常波动，尤其是长期低于5000元工资占比过高的情况。

三、法律依据与权限

• 税务机关可依法查询企业对公及个人账户资金流水，但需依法定程序审批；

• 通过《税收征管法》授权，对涉嫌人员储蓄存款进行调查。

四、建议与风险提示

• 企业应规范工资发放流程，确保所有收入入账并依法代扣代缴个税；

• 个人需关注工资条明细，核对申报金额与银行流水的一致性，避免因疏漏产生税务风险。