合法，但需合规操作

公司通过个人账户发放工资的合法性需根据具体操作方式和税务合规性综合判断，具体分析如下：

一、合法情形

1. 特殊场景的合规操作

   若公司因财务管理简化、员工流动性大（如偏远地区小型企业）等合理原因，经与员工协商一致，并按实际工资足额发放，且依法履行纳税申报义务，可通过个人账户发放工资。

2. 代发工资的合法途径

   若委托其他个人代发工资，需计入"其他应付款"科目核算，且需提供合法代发协议。

二、违法情形（逃税或违规操作）

1. 以私代公的逃税行为

   若公司通过个人账户发放工资以规避税款、少缴或不缴，如伪造账簿、虚报收入、不申报或少申报应纳税所得额，将构成偷税漏税，可能面临刑事责任。

2. 逃避社保与个税

   通过个人账户发放工资可能导致社保基数降低、个税漏缴，影响员工医疗、养老等权益，同时增加公司税务风险。

三、法律风险与建议

1. 税务合规性

   公司必须依法申报纳税，工资流水需与劳动合同、银行流水等凭证匹配。若被税务机关查实，需补缴税款、滞纳金，并可能面临罚款或刑事责任。

2. 劳动合同与证据保留

   建议通过银行代发工资，保留代发凭证；若使用个人账户，需与员工签订书面协议明确资金用途，并确保资金流向可追溯。

3. 风险防范建议

   • 小型公司优先使用对公账户，大额支付需通过正规金融机构办理；

   • 员工应留存工资条、银行流水等证据，以维护自身权益。

公司通过个人账户发工资的合法性需以合规操作和依法纳税为前提，建议根据自身情况选择合规方式，并咨询专业机构降低法律风险。