防止会计凭证丢失需从制度、技术和管理三方面入手，具体措施如下：

一、完善内部控制制度

1. 明确保管责任 ：建立凭证传递、装订、归档流程，确保每份凭证有据可查，装订时需加盖封面、封签并签名。

2. 设立专门档案室 ：配备防盗设施，限制非授权人员接触，采用防潮、防火的专用档案柜存放。

二、强化技术保障措施

1. 双重备份机制 ：对电子凭证加密存储并定期备份，防止数据丢失或篡改；采用电子会计档案系统实现数字化管理。

2. 信息安全管理 ：通过权限控制、审计日志等技术手段，保障电子凭证的安全性。

三、加强日常管理与监督

1. 定期审计检查 ：通过内部审计或外部审计，核查凭证的完整性和真实性，及时发现并纠正问题。

2. 应急预案制定 ：凭证丢失时立即启动预案，尝试获取替代证明材料，并调整账务处理。

四、特殊行业额外要求

不同行业（如金融、税务）可能对凭证保存期限有更严格规定，需结合行业特性制定专项管理措施。