不合法

根据我国现行法律法规，公司无权对员工进行罚款，即使金额较小（如1000元）。以下是具体分析：

一、公司罚款的合法性问题

1. 无权罚款

   公司不属于行政机关或司法机关，不具备对公民行使经济处罚权的法律授权。根据《行政处罚法》第七条，只有法律、法规和规章才能设定行政处罚，企业无权制定罚款条款。

2. 特殊情形的赔偿要求

   若员工因自身过错导致公司损失，公司可依据《劳动合同法》约定要求赔偿，但赔偿金额不得超过当地最低工资标准，且需从员工工资中扣除。

二、工资单签字的法律效力

1. 签字的效力

   工资单作为劳动合同的补充文件，员工签字确认后具有法律效力。签字行为表明员工对工资构成、扣款依据等内容的认可。

2. 争议解决途径

   若对工资单内容存在异议，员工可通过以下途径解决：

   • 协商或调解

   • 申请仲裁或诉讼。

三、建议与注意事项

• 完善劳动合同 ：明确工作职责、考核标准及奖惩机制，避免模糊条款。

• 保留证据 ：保存工资单、奖惩记录等证据，以便在争议中维护权益。

• 合法处罚方式 ：可依据《劳动合同法》约定扣除绩效奖金或要求赔偿损失，但需符合法律限制。

公司罚款1000元的行为违法，但员工可通过法律途径维护自身权益。工资单签字在合法范围内有效，但需注意签字时的知情权。