企业未依法为员工申报个人所得税属于违法行为，将面临以下后果及处理方式：

一、企业后果

1. 税务处罚

   • 罚款 ：首次违规可被责令限期改正，处2000元以下罚款；若导致国家税收损失或欠税，罚款金额可达2000-1万元。

   • 滞纳金 ：未按时缴纳税款需缴纳滞纳金，加重经济负担。

   • 信用记录 ：被列入税务不良记录，影响企业信誉，可能被重点监管。

2. 法律追责

   • 行政处罚 ：除罚款外，还可能承担其他行政责任，如补缴税款。

   • 民事赔偿 ：若因逃税导致国家损失，企业可能被要求承担民事赔偿责任。

二、员工权益保护

1. 追缴税款

   • 员工可要求企业补缴欠税，并可能被加收滞纳金，影响个人信用记录。

   • 若企业恶意逃税，员工可向税务机关举报，要求追责。

2. 信用影响

   • 企业未申报行为可能被记录在个人信用报告中，导致购房、购车等需纳税证明的事项受阻。

三、处理建议

1. 内部沟通

   • 员工可与企业财务部门核实薪资明细，要求补缴税款。

   • 若沟通无果，可通过劳动仲裁或法律途径**。

2. 税务举报

   • 向税务机关提交书面举报，提供薪资单、劳动合同等证据，要求立案查处。

   • 经济发达地区可申请调阅年度纳税清单，核对扣税准确性。

四、特殊情形说明

• 零申报合法性 ：若企业无工资支出或因合理原因（如停工）导致应纳税所得额为0，可零申报，但需保留相关证明材料。

总结 ：企业未申报个税需承担经济与信用双重处罚，员工可通过举报或法律途径维护权益。建议双方优先通过协商解决，必要时寻求专业法律支持。