在事业单位中，如果员工请假超过6个月，则会涉及到一系列严格的规章制度处理。超过六个月的病假时间不计算连续工龄，但在此期间仍需依法缴纳社会保险费，且职工的退休和医疗保险不受影响。 根据工作人员的工作年限，从第七个月起将按照不同的比例发放病假工资。

• 病假工资计算标准：对于工作年限不满十年的员工，从病假第七个月开始，病假工资按基本工资的70%发放；而工作年限满十年不满二十年的员工，则按80%发放；工作年限达到二十一年及以上的员工，病假工资则为基本工资的90%。需要注意的是，享受省部级及以上劳动模范待遇的人员，在病假超过六个月后，其病假工资可以在相应工作年限计发病假工资基础上提高10%-15%。

• 医务鉴定与后续处理：若请病假超过六个月，单位须对请假者进行医务鉴定。经县级以上医务鉴定部门鉴定能坚持正常工作的，但本人拒不上班的，按旷工论处；如符合病退条件，则办理病退手续。对于因病不能正常工作，但未完全丧失工作能力的情况，可以继续休假，每满六个月再进行一次鉴定以决定是否准予继续休假。

• 事假的相关规定：除了病假之外，事业单位的事假也有严格的规定。工作人员请事假全年累计超过20天或一次性事假超过15天的，其超过天数的工资按本人基本工资的不同比例计发，具体比例依据超出天数有所不同。事假累计超过一定天数的，将不再享受当年的职工休假待遇，并可能影响到年度考核结果和晋升机会。

总结而言，事业单位员工请假超过六个月时，不仅会影响到工资的发放标准，还关系到连续工龄的计算以及后续的职业发展。无论是病假还是事假，都应当遵循相应的程序和规定来申请，并确保提供必要的证明材料。单位也应适时跟进员工情况，确保制度执行到位，保障双方权益。