根据2025年最新政策，农村自建房超出老宅基地面积的收费方式如下：

一、收费标准（阶梯式收费）

1. 不超标部分（≤20㎡）

   免收有偿使用费。

2. 中等超标（20-70㎡）

   按每年每平方米3元收费。

3. 严重超标（70-120㎡）

   按每年每平方米6元收费。

4. 超100㎡以上

   部分地区（如湖南）对超180㎡部分按5-15元/㎡收费，具体因地区而异。

二、处理原则

• 历史遗留问题 ：若超标面积符合村庄规划，可申请有偿使用；不符合规划的，可能面临拆除或退还。

• 逾期不交 ：将依法处罚，可能包括罚款等。

三、地区差异

• 河北 ：标准为宅基地≤200㎡，建设用地≤266㎡。

• 江苏 ：自然资源厅已明确具体实施细则。

• 湖南 ：汨罗市川山坪镇等乡镇有细化标准（如180㎡基准线）。

四、注意事项

• 收费依据当地政策执行，建议咨询村委会或自然资源部门获取最新标准。

• 严重超标宅基地可能被回收处理。