宅基地超过面积的处理方式需根据建房时间、是否经批准及当地政策综合判断，具体分为以下几种情况：

一、按时间阶段划分处理原则

1. 1982年《村镇建房用地管理条例》实施前（1982年前建房）

   若宅基地超面积但未超过1987年《土地管理法》实施前的当地标准，按实际使用面积确权登记。

2. 1987年《土地管理法》实施后（1987年后建房）

   • 未经批准超面积 ：原则上不予确权登记，但符合规划且依法处理的超面积可保留使用，仅登记批准部分，超出的在登记簿中注记。

   • 历史转让或赠与超面积 ：按当时政策（即1987年前的政策）处理。

二、具体处理方式

1. 补办手续确权

   若超面积部分已取得合法批准，需补办用地手续后，以批准面积为准确权登记。

2. 部分确权与费用缴纳

   • 部分确权：仅登记批准标准内的面积，超出的部分不纳入证书。

   • 付费确权：超出的面积需缴纳一定费用后才能全部确权（如河北、天津等地按面积收费）。

3. 历史追溯与政策统一

   对通过转让、赠与等方式取得的超面积宅基地，按当时政策（即取得时间对应的法规）处理，避免因政策变动引发纠纷。

三、特殊情况处理

1. 进城落户村民

   若村民已进城落户，需遵守自愿有偿退出宅基地的政策。

2. 强制收回与暂时保留

   • 强制收回 ：如未拆除旧房、欺骗手段获取宅基地等，可能被****或收回。

   • 暂时保留 ：因拆除影响相邻居住安全或公共利益时，可暂时保留该宅基地。

3. 宅基地相抵与补偿

   符合土地利用规划的超面积，可通过宅田相抵（用耕地弥补）或缴费补偿的方式继续使用。

四、建议与注意事项

• 结合自身情况 ：需明确建房时间、是否经批准及当地具体标准，对照政策判断。

• 及时咨询当地部门 ：不同地区政策存在差异，建议通过乡镇政府或自然资源部门获取最新政策细则。

（注：以上内容综合了自然资源部及各地政策文件，具体操作请以当地最新规定为准。）