小规模纳税人可以通过以下几种方式抵扣税费：

1. 增值税普通发票抵扣：小规模纳税人取得的增值税普通发票，虽然不能直接抵扣增值税销项税额，但可以在企业所得税税前列支，减少企业所得税应纳税所得额。

2. 农产品收购发票或销售发票抵扣：小规模纳税人购买农产品，可以按照买价和13%的扣除率计算进项税额，从当期销项税额中抵扣。

3. 税控设备抵扣：小规模纳税人首次购买增值税税控系统专用设备支付的费用，以及缴纳的技术维护费，可以全额抵减增值税应纳税额。

4. 地方税收优惠政策：部分地区可能存在针对小规模纳税人的税收优惠政策，如减征或免征部分地方税种，小规模纳税人可以关注并利用这些政策来降低税费负担。

5. 小型微利企业税收优惠：符合条件的小规模纳税人，如果被认定为小型微利企业，可以享受企业所得税减半征收的优惠政策，进一步降低税费负担。

6. 其他合法途径：小规模纳税人还可以通过其他合法途径，如合理规划经营活动、优化成本结构等，来间接降低税费负担。

总结：小规模纳税人可以通过多种方式抵扣税费，包括增值税普通发票抵扣、农产品收购发票或销售发票抵扣、税控设备抵扣、地方税收优惠政策、小型微利企业税收优惠以及其他合法途径。合理利用这些抵扣方式，可以有效降低小规模纳税人的税费负担。